ポケモンマスターを目指し、旅を続けるサトシたち一行は、「ダイヤモンド鉱国」のお姫様ディアンシーと出会う。ディアンシーは滅亡の危機にある国を救うために、「生命のポケモン」ゼルネアスを探しているのだった。そんなディアンシーに意気投合したサトシたちだったが、ダイヤモンドを作るディアンシーの能力をねらっている敵が次々と襲ってくる!さらにその騒ぎによって「破壊のポケモン」イベルタルも目覚めさせてしまって...。度重なるピンチをサトシたちとディアンシーはのりこえることができるか...!?