始まりは京都で起こった謎の殺人事件だった。被害者は元幕府の要人。そして遺体には、奇妙な紋様が残されていた。次々起こる不敵な予告殺人。事件の謎を解くために、仲間と京都にむかった剣心たちを待ち受けていたのは、なんと、剣心と同じ飛天御剣流を使う剣士・天草翔伍。その腕は剣心と互角かそれ以上...。天草四郎の再来と謳われるキリシタン剣士の野望とは!?待望のアニメノベライズ登場!!