コナンと少年探偵団が迷い込んだ山奥の村。地図にものっていない不思議な村で、突然起きた歩美ちゃん誘拐事件!姿を見せぬ犯人の狙いはなに?そして村に隠された大きな秘密とは?昆虫忍者と少年探偵団の戦いが始まる!!コナンと冒険を楽しみながら、昆虫博士になろう。