コナンと少年探偵団が訪れた地球環境の実験設備・Cドーム。外界と切り離されたドーム内で白骨死体が発見され、同時にドーム内のCO2濃度をめぐる恐ろしい計画が発動した。孤立したもう一つの地球・Cドームでコナンのサバイバルが始まる。