主人公の少年トム・スキャッタホーンは、11歳の冬、英国の港町ドラゴンポートの小さな博物館を管理しているおじさんの家にあずけられることになる。そこに、怪しげなドン・ジャーヴェス・アスカリとその娘が現れ、不思議な事件が起こり始める。博物館の古い剥製の動物たちが動きだし、泥棒が入ったことがきっかけで、ぐうぜん100年前の世界に...。やがて剥製職人オーガストの秘密を知ったトムに、身の危険がせまる!トムはこの博物館を守ることができるのか。