比較法は従来，生態学者により多く用いられてきたが，近年，系統樹の情報の利用が必須との認識が定着してきた．生物の進化を考える際，生態学的な視点と系統学的な視点とは別個のものとされることが多かったが，両者を統合していく上でも比較法の新しい方法論は不可欠のものとなってきた．