Los alimentos funcionales se definen como alimentos que además de satisfacer las necesidades nutricionales básicas, existe evidencia de que contienen compuestos bioactivos, que, al ser consumidos de forma habitual como parte de dieta balanceada, son capaces de brindar beneficios fisiológicos y protección contra enfermedades crónico-degenerativas. En este aspecto, el presente estudio realiza una valoración de la harina de las plantas de mezquite (Prosopis juliflora y Prosopis granulosa). Para la determinación de metabolitos secundarios como flavonoides, compuestos fenólicos totales y capacidad antioxidante, proteína y azúcares, presentes en harina de las semillas de las especies de mezquite estudiadas. Los resultados indicaron que la harina de semilla presenta contenidos importantes de estos metabolitos secundarios, que podrían ser empleados en la generación de alimentos funcionales con potencial de ser empleados en el control de la diabetes tipo 2.