北町奉行・遠山景元直属の影同心の一人であるお連は、御岳の山奥にある不知火の里の伊賀者であった。十六年前に不知火の里から逃れたお連は我が子を養女に出したが、その娘を伊賀者の頭目・風の勘兵衛に奪われてしまう。反目する南町奉行・鳥居耀蔵の探索方の襲撃を受けるなか、遠山景元と影同心三人は、伊賀者一党が密かに企てた将軍暗殺の野望を打ち砕くため修羅場をかいくぐる。