En unas pruebas militares, el Pentágono desentierra un ovni que no puede abrir. Contrata a Mark Temple, un civil que trabaja para la N.A.S.A. El ovni está controlado por una I.A. (Lara) que entabla un diálogo con Mark. Este, tras muchos intentos fallidos consigue que la compuerta de carga, controlada por una I.A. de menor rango, acceda a abrirse. Cuando lo consigue, Mark es expulsado sin permitirle ver lo que contiene. Una vez fuera, Lara establece contacto con Mark y le revela la historia de su dueño, de la raza que la construyó y la de la terrible guerra que les llevó al exterminio. También le explica que la apertura de la compuerta conllevará la extinción de la vida en la Tierra y de una segunda amenaza que es mucho más terrible. La situación se convierte en una cuenta atrás para localizar al tripulante