東京のあちこちでヴァンデモンの部下のデジモンたちが暴れ出し、お台場の人々はヴァンデモンの食料にされるため、巨大総合展示場東京ビッグサイトにとらわれていた。その中にはミミの姿もあった。太一・ヒカリ・空・ヤマト・タケル・光子郎・ミミ・丈。「選ばれし子ども」たちはパートナーデジモンとともに、それぞれの思いを抱えながら、ヴァンデモンに戦いを挑む。