統一宇宙暦940年。超大国ガメリカは最新兵器を導入した。サイバネティックスで身を包み、どんな命令にも絶対服従する人型の最終兵器「CORE」。戦艦と頭脳を直結したその機動力と火力に日本帝国艦隊はしだいに追い詰められていく。しかし、ガメリカも計算していなかった事態が起こる。絶対服従なはずの「CORE」たちが反乱を起こしたのだ!凶悪犯罪者の頭脳を改造したそれは、かつての快楽を取り戻すように世界規模で破壊と虐殺を繰り返す。そしてついには眠れる人工大怪獣“バージニア”までも復活させ、人類に復讐を遂げようとし始めた。無敵と化した人工頭脳艦隊を相手に、果たして日本帝国は、人類は、生き残れるのか!?―。