Het geheim van Amsterdam is een spannend nieuw ruimte-avontuur van astronaut André Kuipers, onderdeel van de al twintig jaar megapopulaire Geheim-serie. In dit verhaal, wat ter gelegenheid van 750 jaar Amsterdam verschijnt, is er paniek in Amsterdam! De Dam is verdwenen. Komt het door een aardbeving? Of is er een komeet ingeslagen? Ishan is alleen thuis als hij dit nieuws op het journaal ziet. Toch gaat hij naar buiten. Daar wordt hij in een tunnel gezogen en komt samen met een onbekend meisje op de landingsbaan van een raket terecht. Een vreemde stem geeft hen opdracht met die raket de ruimte in te gaan. Alleen zij kunnen de aarde redden...