凶悪犯罪が絶えないゴッサムシティ。若き精神科医ハーレイ・クインは、​​ある夜ルームメイトの遺体を発見する。
そこには謎の連続殺人犯、ジョーカーの痕跡があった。
事件は未解決のまま5年の月日が経ち、またしてもジョーカーによる殺人事件が発生してしまう。
凶悪犯罪のプロファイラーとしてゴッサム市警に協力するハーレイは、ジョーカーの正体を突き止めようと躍起になり、死屍累々の追走劇が始まる！